Paturages Comtois werd op 1 januari 1985 opgericht door de fusie van verschillende gemeentelijke bedrijven tussen 1985 en 1996. Deze coöperaties, van oudsher producenten van IGP Grand Cru Emmental met rood label, hadden zich gediversifieerd naar de productie van zachte kazen met een bloomachtige korst en gewassen korst.
Dankzij menselijke en commerciële betrekkingen heeft Pâturages Comtois zich op de exportmarkt gepositioneerd (Europa, Verenigde Staten, Canada, Oekraïne, Israël, Midden-Oosten, enz.) De laatste stap in de opbouw van Pâturages Comtois was de overname van Fleuron des Gourmets in 2017.